| | E-cadherin gene polymorphisms and susceptibility to urolithiasis in Iraqi children| العنوان باللغة العربية : | E كادهرين تعدد الأشكال الجينية وقابلية التحص البولي في الأطفال العراقيين | | العنوان باللغة الانكليزية : | E-cadherin gene polymorphisms and susceptibility to urolithiasis in Iraqi children | | المؤلف : | SHAHA HUSSEIN ALI | | البريد الالكتروني : | Shatha6ali@yahoo.com | | جهة انتساب المؤلف : | Department of Pediatrics, College of Medicine, Al Nahrain University, Al – Kadhymia, P. O. Box 70074, Baghdad, Iraq | | المشاركين : | HAIDAR AHMED SHAMRAN, MAYASA ABDULLA ALI, QASIM SHARHAN AL-MAYAH, ELHAM AHMED JASIM | | المستفيدين : | Iraq childrein | | المستخلص : | ABSTRACT: Aim: This case/control study aimed to assess the impact of two single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the promoter region of CDH1 gene (-160C>A and -347G>GA) on urinary stone formation in a sample of Iraqi children. Methods: Forty-seven children with urolithiasis and 50 age- and gendermatched healthy controls were included in the study. DNA was isolated from peripheral blood and direct sequencing was used for genotyping. Results: The homozygous genotype of the SNP CHD1 -160C>A was more frequent in control than cases (18% vs. 6.38%) with significant difference (OR = 0.229, 95%CI = 0.056–0.943, P = 0.041). Furthermore, cases showed significantly less frequency of the mutant allele (allele A) of this SNP (OR = 0.403, 95%C = 0.210–0.776, P = 0.007). Conclusion: These results strongly indicate a protective role of allele A of the SNP CHD1 -160C>A against urinary calculi formation in children ABSTRACT: Aim: This case/control study aimed to assess the impact of two single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the promoter region of CDH1 gene (-160C>A and -347G>GA) on urinary stone formation in a sample of Iraqi children. Methods: Forty-seven children with urolithiasis and 50 age- and gendermatched healthy controls were included in the study. DNA was isolated from peripheral blood and direct sequencing was used for genotyping. Results: The homozygous genotype of the SNP CHD1 -160C>A was more frequent in control than cases (18% vs. 6.38%) with significant difference (OR = 0.229, 95%CI = 0.056–0.943, P = 0.041). Furthermore, cases showed significantly less frequency of the mutant allele (allele A) of this SNP (OR = 0.403, 95%C = 0.210–0.776, P = 0.007). Conclusion: These results strongly indicate a protective role of allele A of the SNP CHD1 -160C>A against urinary calculi formation in children | | المستخلص باللغة العربية : | الهدف: تهدف دراسة الحالة / السيطرة هذه إلى تقييم تأثير تعدد الأشكال النوكليوتيدات الفردية في منطقة المروج لجين CDH1 (-160 درجة مئوية> A و -347 G> GA) على تكوين حصوات البول في عينة من الأطفال العراقيين. الطريقة: تم تضمين سبعة وأربعين طفلا مصاب بالتهاب المسالك البولية و 50 سنه والضوابط الصحية في الدراسة. تم عزل الحمض النووي من الدم المحيطي وكان التسلسل المباشر يستخدم للتنميط الجيني. النتائج: كان النمط الوراثي متماثل الزيجوت لـ SNP CHD1 -160C> A أكثر تواترًا في السيطرة من الحالات (18٪ مقابل 6.38٪) مع اختلاف كبير (OR = 0.229 ، 95٪ CI = 0.056–0.943 ، P = 0.041). علاوة على ذلك ، أظهرت الحالات انخفاضًا ملحوظًا في تواتر أليل متحولة (أليل A) لهذا SNP (OR = 0.403 ، 95٪ C = 0.210-0.776 ، P = 0.007). الخلاصة: هذه النتائج تشير بقوة إلى دور وقائي للأليل A من SNP CHD1 -160C> A ضد تشكيل الحصوات البولية في الأطفال | | كلمات مفتاحية : | E-cadherin, gene polymorphism, urolithiasis | | الرابط : | 10.1111/nep.13184 |
| |
| | | The Association of Glutaminase (glut) P3 Different Alleles of Trichomonas vaginalis with Infertility in a sample of Iraqi women| العنوان باللغة العربية : | ترابط الاليلات المختلفة لانزيم Glutaminase (glut) P3 من المشعرة المهبليةمع العقم في عينة من النساء العراقيات | | العنوان باللغة الانكليزية : | The Association of Glutaminase (glut) P3 Different Alleles of Trichomonas vaginalis with Infertility in a sample of Iraqi women | | المؤلف : | Hudaath.Almarsome | | البريد الالكتروني : | Hudaalmarsome@yahoo.com | | جهة انتساب المؤلف : | College of Medicine /Al-Nahrain University | | المشاركين : | Faten Ahmed Hassan . Suhad Asaad Mustafa3, | | المستفيدين : | Women with infertility | | المستخلص : | There is low genetic diversity among the local isolates of T. vaginalis according to glut -3 gene sequences. The gene ap-peared in three alleles with a new allele. There is no association between the dif¬ferent alleles of the gene with infertility, clinical features of the infected women and the geographical region of the para¬site. Phylogenetically there are two ma¬jor clades of Trichomonas phylogenetic tree: those related to local isolates and those related to American isolate | | المستخلص باللغة العربية : | هناك انخفاض للتنوع الجيني بين العزلات المحلية للطفيلي للتسسل الجيني ل glut -3 . ظهر الجين في ثلاثة أليلات مع أليل جديد. لا يوجد ارتباط بين مختلف أليلات الجين مع العقم ،المظاهر السريرية للمرأة المصابة والمنطقة الجغرافية للطفيل. الشجرة التطورية هناك نوعان رئيسيان للطفيلي تلك المتعلقة ابلعزلات المحلية وتلك المتعلقة العزلة الأمريكية | | كلمات مفتاحية : | Glutaminase (glut) P3 و Trichomonas vaginalisوInfertility | | الرابط : | |
| |
| | | Evaluation of synergistic effect of CpG-ODN-7909 and Protamine on transfection process mediated by calcium phosphate nanoparticles| العنوان باللغة العربية : | تقييم التاثير التراكمي لل CPG-ODN-7909 والبروتامين على قابلية الجزيئات النانوية للكالسيوم فوسفات لنقل الجينات | | العنوان باللغة الانكليزية : | Evaluation of synergistic effect of CpG-ODN-7909 and Protamine on transfection process mediated by calcium phosphate nanoparticles | | المؤلف : | Ghassaq T. Al-Ubaidi | | البريد الالكتروني : | Ghasaqtariq119@gmail.com | | جهة انتساب المؤلف : | Reserch Unit-College of Medicine -Al -Nahrain University | | المشاركين : | Ahmed A. Abbas , Ali A. Taha, Qasim S. Sharhan, Israa W. Ahmed, Ilham A. Jasim. | | المستفيدين : | Vaccines producers | | المستخلص : | Bacille Calmette-Guerin (BCG) still the only authenticated vaccine against tuberculosis. Due to its drawbacks, a need to a new formula has emerged. Implication of "Nanovaccinology" is one of the possible alternatives. The non-viral vectors has a low transfection ability. In the context, this work aims to add two adjuvants to a calcium phosphate nanoparticles (CPNPs) functionalized with ESAT-6 cloned pcDNA3.1(+) plasmid. ESAT-6 gene is specific to mycobacterium tuberculosis complex (MTC) and encodes a T-cell antigen. The adjuvants in practice are Herring protamine and CpGODN 7909. Each has a different strategies in enhancing immune response, protamine is particulate adjuvant while CpG is an immunopotentiator substance. Nanocomplex was transfected in to THP-1 monocytic cell line after its activation to macrophage via 100nM PMA. Cellular immune response, IL-12 and TNF-ɑ also ESAT-6 protein production were assayed via Sandwich ELISA technique. Results revealed that, CPNPs offer only a partial protection to the adsorbed plasmid against enzymetic degradation. Nanocomplex formula with two adjuvants resulted in significantly higher cellular immune response comparing to formula carrying one adjuvant. In conclusion, implication of CPNPs in gene delivery accompanied with two adjuvants each possess different strategy, will result in partial protection to the delivered gene with upsurge cellular immune response | | المستخلص باللغة العربية : | يهدف هذا اﻟﺒﺤﺚ ل اﺳﺘﺨﺪام ﺟﺰﯾﺌﺎت ﻓﻮﺳﻔﺎت اﻟﻜﺎﻟﺴﯿﻮم اﻟﻨﺎﻧﻮﯾﺔ وﺑﻮﺟﻮد واﻟﺬي ﺗﻢ ﻛﻠﻮﻧﺘﮫ )ﻣﻦ ESAT-6ﻟﻨﻘﻞ ﺟﯿﻦ ال CpG-ODN-7909وال protamineﻣﺎدﺗﻲ ال .pcDNA3.1(+)ﻗﺒﻞ اﻟﻤﺼﻨﻊ( ﻋﻠﻰ ﺑﻼزﻣﯿﺪ ﻧﺎﻧﻮﻣﯿﺘﺮ. ﺗﻢ ﺗﻜﺜﯿﺮ اﻟﺒﻼزﻣﯿﺪ ٦٣ﺗﻀﻤﻦ ھﺬا اﻟﺠﺰء ﺗﺤﻀﯿﺮھﺬه اﻟﺠﺰﯾﺌﺎت ﺑﻄﺮﯾﻘﺔ ﻛﯿﻤﯿﺎﺋﯿﺔ وﺑﺤﺠﻢ ﻓﻲ ﺑﻜﺘﺮﯾﺎ ال E.coli ﺛﻢ ﺗﻢ اﺳﺘﺨﻼﺻﮫ ﺑﺎﺳﺘﺨﺪام ﻋﺪة ﺧﺎﺻﮫ ﻟﺬﻟﻚ -DH-5-alfa ﻋﻠﻰ ﺟﺰﯾﺌﺎت ﻓﻮﺳﻔﺎت اﻟﻜﺎﻟﺴﯿﻮم ESAT-6 ﺗﻢ ﺗﺤﻤﯿﻞ اﻟﺒﻼزﻣﯿﺪ اﻟﺤﺎﻣﻞ ﻟﻠﺠﯿﻦ .(Lipofectamin) اﻟﻨﺎﻧﻮﯾﺔ . ﻛﻤﺎ وﺗﻢ دراﺳﺔ اﻣﻜﺎﻧﯿﺔ اﻻﺳﺘﻔﺎده ﻣﻦ ﺟﺰﯾﺌﺎت ﻓﻮﺳﻔﺎت اﻟﻜﺎﻟﺴﯿﻮم اﻟﻨﺎﻧﻮﯾﺔ ﻟﺤﻤﺎﯾﺔ اﻟﺒﻼزﻣﯿﺪ ووﺟﺪ اﻧﮫ ﯾﻮﻓﺮ ﺣﻤﺎﯾﺔ ﺟﺰﺋﯿﺔ ﻟﮭﺎ ﺿﺪ ھﺬا اﻻﻧﺰﯾﻢ. DNaseﻣﻦ اﻧﺰﯾﻢ ال ﺗﻢ رﺑﻂ اﻟﺒﻼزﻣﺪ ﺑﺎﻟﺒﺮوﺗﺎﻣﯿﻦ ﺑﻨﺴﺐ وزﻧﯿﺔ ﻣﺨﺘﻠﻔﺔ ﻛﻤﺎ ﺗﻢ رﺑﻂ اﻟﺒﻼزﻣﺪ ﻋﻠﻰ ﺳﻄﺢ ﺟﺰﯾﺌﺎت ﻓﻮﺳﻔﺎت ﺑﻤﺎدة اﻟﮭﻼم EMSA اﻟﻜﺎﻟﺴﯿﻮم ﺑﻨﺴﺐ ﺣﺠﻤﯿﺔ ﻣﺨﺘﻠﻔﮫ وﺗﻢ ﻓﺤﺺ اﻟﺮﺑﻂ ﺑﺎﺳﺘﺨﺪام اﺧﺘﺒﺎر ال ﺑﺠﺰﯾﺌﺎت ﻓﻮﺳﻔﺎت اﻟﻜﺎﻟﺴﯿﻮم اﻟﻨﺎﻧﻮﯾﮫ ﺑﻨﺴﺐ CpG-ODN-7909 .ﻛﺬﻟﻚ ﺗﻢ رﺑﻂ ال agarose1% ﺑﺴﺒﺐ Polyacrylamideﺣﺠﻤﯿﺔ ﻣﺨﺘﻠﻔﺔ وﺗﻢ ﻓﺤﺺ اﻟﺮﺑﻂ ﺑﻨﻔﺲ اﻟﻄﺮﯾﻘﺔ ﻟﻜﻦ ﺑﺎﺳﺘﺨﺪام ﻣﺎدة ال . CpGﺻﻐﺮ ﺣﺠﻢ ال (4,5- اول ﺧﻄﻮه ﻓﻲ ﻣﻌﺎﻣﻠﺔ اﻟﻤﻌﻘﺪات اﻟﻨﺎﻧﻮﯾﺔ ﻟﻠﺨﻼﯾﺎ ھﻲ ان ﺗﻢ اﺧﺘﺒﺎر ﺳﻤﯿﺘﮭﺎ ﺑﺎﺳﺘﺨﺪام ﻣﺎدة ال dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium bromide tetrazolium وﺛﻢ ﺗﺤﻔﯿﺰھﺎ (THP-1monocyte) وﻟﻮﺣﻆ اﻧﮭﺎ ﻏﯿﺮ ﺳﺎﻣﮫ. ﺗﻢ ﺗﻨﻤﯿﺔ ﺧﻂ ﺧﻼﯾﺎ (MTT) Phorbol 12-myristate 13-acetate ﺑﺎﺳﺘﺨﺪام ﻣﺎدة ال (THP-1macrophage)اﻟﻰ ﺗﻢ ﺗﺤﻀﯿﺮ ﻣﻌﻘﺪ ﻧﺎﻧﻮي ﻣﻦ ﺟﺰﯾﺌﺎت ﻓﻮﺳﻔﺎت اﻟﻜﺎﻟﺴﯿﻮم اﻟﻨﺎﻧﻮﯾﺔ وﺑﺮوﺗﯿﻦ .(PMA) وﺗﻤﺖ ﺗﺠﺮﺑﺔ اﻟﻤﻌﻘﺪ اﻟﻨﺎﻧﻮي اﻟﺴﺎﺑﻖ ﻋﻠﻰ ﺧﻂ اﻟﺨﻼﯾﺎ CpG-ODN-7909 و ال (Protamin)ال ﻛﻤﺆﺷﺮ ﻟﺘﺤﻔﯿﺰ اﻟﻤﻨﺎﻋﮫ اﻟﺨﻠﻮﯾﮫ ﻛﻤﺎ ﺗﻢ ﻓﺤﺺ اﻧﺘﺎج TNF-ɑو IL-12ودراﺳﺔ اﻧﺘﺎج اﻟﺨﻼﯾﺎ ل . وﻗﻮرﻧﺖ اﻟﻨﺘﺎﺋﺞ ﺑﻤﻌﻘﺪات ﻧﺎﻧﻮﯾﮫ اﺧﺮى ﺗﻢ ELISA و ذﻟﻚ ﺑﺎﺳﺘﺨﺪام ﺗﻘﻨﯿﺔ ال ESAT-6ﺑﺮوﺗﯿﻦ ال ﺗﺤﻀﯿﺮھﺎ ﺑﻨﻔﺲ اﻟﻄﺮﯾﻘﺔ ﻟﻜﻨﮭﺎ ﻣﻨﻘﻮﺻﮫ ﻻﺣﺪ اﻟﻤﻜﻮﻧﺎت . DNA:AuNP 1:500ﻣﻦ ﺧﻼل ھﺬه اﻟﺪراﺳﮫ ﺗﻤﻜﻨﺎ ﻣﻦ اﻟﺤﺼﻮل ﻋﻠﻰ ﻧﺘﺎﺋﺞ دﻗﯿﻘﮫ وﺑﻨﺴﺒﺔ ﻣﻮﻻرﯾﺔ ﺳﺎﻋﮫ اﻟﻰ ﺳﺎﻋﺘﯿﻦ .وﺑﻤﺎ ١٢وﺗﻤﻜﻨﺎ ﻣﻦ ﺗﻘﻠﯿﻞ اﻟﻮﻗﺖ ﻣﻦ AFMو DLS ووﺑﺎﺳﺘﺨﺪام ﺟﮭﺎزي ال ﯾﺨﺺ اﻟﺠﺰء اﻟﺜﺎﻧﻲ ﻣﻦ اﻟﺒﺤﺚ ﻓﻘﺪ وﺟﺪ ان رﺑﻂ اﻟﺒﻼزﻣﯿﺪ ﻋﻠﻰ ﺳﻄﺢ ﺟﺰﯾﺌﺎت ﻓﻮﺳﻔﺎت اﻟﻜﺎﻟﺴﯿﻮم .ﻛﻤﺎ ان وﺟﻮد ﻣﺎدﺗﻲ اﻟﺒﺮوﺗﺎﻣﯿﻦ وال DNaseاﻟﻨﺎﻧﻮﯾﺔ ﯾﻮﻓﺮ ﻟﮭﺎ ﺣﻤﺎﯾﺔ ﺟﺰﺋﯿﮫ ﻣﻦ ﺗﺤﻄﯿﻢ اﻧﺰﯾﻢ ال ﯾﺰﯾﺪ ﻣﻦ ﻓﻌﺎﻟﯿﺔ اﻟﺠﺰﯾﺌﺎت اﻟﻨﺎﻧﻮﯾﺔ ﻓﻲ اﻟﻨﻘﻞ اﻟﺠﯿﻨﻲ ووﺟﻮدھﺎ ﻣﻌﺎ ﯾﻌﻄﻲ ﺗﺄﺛﯿﺮ CpG-ODN-7909 TNF-ɑو IL-12ﺗﺮاﻛﻤﻲ وﻗﺪ ﺗﻤﺜﻞ ھﺬا ﺑﺰﯾﺎدة اﻟﻤﻨﺎﻋﺔ اﻟﺨﻠﻮﯾﺔ اﻟﻤﺘﻤﺜﻠﺔ ﻓﻲ ﻓﻲ زﯾﺎدة اﻧﺘﺎج ال ﻟﻠﺨﻼﯾﺎ اﻟﻤﻌﺎﻣﻠﺔ ﺑﺎﻟﻤﻌﻘﺪ اﻟﻨﺎﻧﻮي اﻟﻜﺎﻣﻞ ﻣﻘﺎرﻧﺔ ﺑﺎﻟﺨﻼﯾﺎ اﻟﻤﻌﺎﻣﻠﺔ ESAT-6وﻛﺬﻟﻚ اﻧﺘﺎج ﺑﺮوﺗﯿﻦ ال ﺑﻤﻌﻘﺪات ﻣﻨﻘﻮﺻﺔ ﻻﺣﺪ اﻟﻤﻜﻮﻧﺎت | | كلمات مفتاحية : | CpG-ODN-7909, protamine,CPNPs, THP-1 cell line | | الرابط : | |
| |
|
|
